رابطه خوب مرتضی پورعلی گنجی با بازیکنان پرسپولیس باعث شد شائبه پرسپولیسی بودن این مدافع ملی‌پوش مطرح شود. البته خود پورعلی گنجی هم هیچوقت این موضوع را تکذیب نکرد به همین دلیل اصلاً بعید نیست وقتی دوباره به فوتبال ایران برگردد راهی تیم سرخپوش پایتخت شود. همین موضوع باعث شده هواداران پرسپولیس به محض دیدن پست جدید از پورعلی گنجی برای او کامنت بگذارند که پرسپولیسی شود. پورعلی گنجی هم در پستی که به تازگی منتشر کرده طعنه‌ای به دوستان قدیمی‌اش مهدی طارمی و رامین رضاییان زده و نوشته که باید ارزش رفاقت حفظ شود. این پست باعث شد هواداران پرسپولیس که اکثر فالویرهای پورعلی گنجی را تشکیل می‌دهند، از او بخواهند به رابطه این دو بازیکن ورود کند و آنها را آشتی دهد. ضمن این‌که برخی هم از این مدافع ملی‌پوش خواسته‌اند امسال به پرسپولیس که قهرمان لیگ شده ملحق شود تا بتواند‌ سال آینده به همراه این تیم در لیگ قهرمانان آسیا حضور داشته باشد. پورعلی گنجی در سالی که گذشت برای تیم السد در کنار ژاوی هرناندز بازی کرد و نایب قهرمان لیگ ستارگان شد.